Multirezisztens E. coli törzsek antibiotikum rezisztencia és virulencia génjeinek molekuláris epidemiológiai elemzése

Abstract

„Multirezisztens E. coli törzsek antibiotikum rezisztencia és virulencia génjeinek molekuláris epidemiológiai elemzése” c. értekezésemben a tetraciklin, a gentamicin és a plazmidon kódolt kinolon rezisztencia hármas témakörére építve, feladatainkat elsősorban az állati és humán eredetű, kommenzalista illetve kórokozó E. coli baktériumok antibiotikum rezisztencia és virulencia génmintázatainak jellemzése és e gének közötti esetenkénti kapcsolatok molekuláris epidemiológiai szemléletű elemzése képezte. Közelebbi célunk volt:

Sertések választási hasmenése kapcsán izolált multirezisztens enterotoxikus E. coli (ETEC) törzsek virulencia/rezisztencia gén-, és plazmid analízise által a tetraciklin rezisztenciát közvetítő tet(A) plazmidok szerepének vizsgálata az antibiotikum rezisztencia (és virulencia) gének átadásában. Haszonállatokból és humán mintákból származó aminoglikozid (gentamicin) rezisztens klinikai és kommenzalista E. coli törzsek antibiotikum rezisztencia és virulencia genotípusainak minél átfogóbb jellemzése. Plazmidon kódolt kinolon rezisztencia (és esetlegesen társult virulencia) gének kimutatása, és a kinolon rezisztenciát hordozó plazmidok jellemzése, egészséges sertésekből származó, kommenzalista multirezisztens E. coli törzsekben. A korábban, csoportunk által részletesen tanulmányozott, tetraciklin rezisztenciáért (tet(B)) és enterotoxigenitásért felelős pTC plazmid jellemzése után jelen munka keretében egy magyar és egy cseh sertés eredetű F18+ ETEC törzs tet(A) gént hordozó konjugatív plazmidjainak részletes elemzését nemzetközileg elsőként végeztük el. A fenti ETEC törzsek eltérő méretű, IncI1 típusú tet(A) plazmidjai multirezisztenciát és sajátos elrendezésű 1-es típusú integront hordoztak, ismert virulencia génekkel viszont nem társultak. Nagy áteresztőképességű PCR-microarray rendszerekben, összesen ~130 rezisztencia és virulencia gén mintázata alapján emberben és élelmiszertermelő állatokban előforduló klinikai és kommenzalista E. coli törzsek antibiotikum rezisztencia és virulencia gén rezervoár szerepéről, és ezen belül egyes rezisztencia és virulencia gének együttes előfordulásáról nemzetközileg elsőként szolgáltattunk összehasonlító genotipizálási adatokat. Végül, elsőként mutattuk ki a sertés eredetű E. coli törzsek plazmidon közvetített kinolon rezisztenciáját Európában, és nemzetközi elsőséggel jellemeztük a qnrS1 gént hordozó plazmidot háziállatokban. A qnrS1-pozitív sertés E. coli törzsek három olyan MLST klónját írtuk le, melyeket eddig sertések között nem ismertünk.