Amerikai hüllőkben előforduló adenovírusok diverzitásának felmérése élő állatok szűrővizsgálatával
Absztrakt
Az adenovírusok (AdV-ok; Adenoviridae) ikozaéder alakú, közepes méretű, burok nélküli virionnal és duplaszálú DNS genommal rendelkező vírusok. Jelenlétüket minden főbb gerinces osztály képviselőjében kimutatták, ennek megfelelően igen változatosak. Az egyes típusok ritkán lépik át a gazdafaji határokat, így jó modellek koevolúciós vizsgálatokhoz. Az AdV-okat jelenleg 5 genusba sorolják. Ezek közül az Atadadenovirus genus tagjait először kérődzőkben, majd madarakban és egy erszényesben írták le. Gazda-eredetük után kutatva az ősibb gerinces osztályokra terelődött a figyelem. A hal, kétéltű és hüllő adenovírusok molekuláris genetikai vizsgálat tisztázta, hogy a pikkelyes hüllők adenovírusai egyértelműen ugyanebbe a genusba sorolhatók. A molekuláris biológiai módszerek elterjedése és egy hatékony PCR módszer kidolgozása lehetővé tette a széleskörű felmérő vizsgálatokat. Célzott szűrővizsgálatok eredményei is megerősítették, hogy a fogságban tartott, elpusztult pikkelyes hüllőkben gyakori (10% körüli) az AdV fertőzöttség. A filogenetikai elemzések megerősítették a pikkelyes hüllő-eredetet. Érdekes módon a legújabban felfedezett teknős-eredetű AdV-ok egy különálló ágon helyezkednek el a törzsfán, feltehetőleg egy újabb nemzetség képviselői. A jelen munka elsődleges célja további hüllő-eredetű minták vizsgálata volt az adenovírusos fertőzöttség kimutatása, az újonnan talált vírusok diverzitásának felmérése, és esetleg további teknős-AdV-ok felderítése céljából. Mivel az AdV diverzitás és abundancia szempontjából eddig még nem végeztek felméréseket szabadon élő, egészséges állatokban, ez is munkám célkitűzései között szerepelt. Egy amerikai egyesült államokbeli halgazdaságban szabadon élő, látszólag egészséges hüllők mintáinak PCR-es szűrését végeztük el. A DNS-t alkoholban tartósított kloákatamponokból izoláltuk. A kétkörös, konszenzus primereket alkalmazó PCR során kapott termékeket szekvenáltuk, majd törzsfa-rekonstrukciót végeztünk.