Denevérből származó minták PCR-es szűrése különféle vírusokra: új vírusok részleges genetikai jellemzése

Abstract

Az 1900-as évek vége óta jelentős figyelem irányul a denevérekben előforduló kórokozók kutatására. Számos olyan vírust találtak ebben a változatos emlőscsoportban, melyek az emberre is fenyegetést jelentenek, pl. a veszettség vírusa, SARS, Ebola, Hendra és Nipah vírusok. A denevérek más vírusai is érdekesek, többek között a vírusok diverzitásának megismerése miatt, így a kutatásunk tárgyát képező adeno- és herpeszvírusok is. Ezek a DNS vírusok lassúbb evolúciójuk révén a nagyobb időtávú evolúció kutatásának fontos alanyai. Vizsgálatunk során kambodzsai és magyarországi, illetve néhány erdélyi mintát vizsgáltunk PCR eljárással, adeno- és herpeszvírusokat keresve. Három magyar mintában találtunk új adenovírust, melyek mindegyike külön fajból (hegyesorrú denevér, közönséges késeidenevér és szoprán törpedenevér) került elő. A mintagyűjtést elsősorban hálózott és húrcsapdával befogott egyedekre alapoztuk (ilyenkor a begyűjtött minták gazdafaja egyértelmű). Az egyedi mintavételezésen alapuló gyűjtés során a korábbi módszereknél talált prevalenciánál alacsonyabb fertőzöttségi szintet tapasztaltunk, melynek egyik oka az lehet, hogy a kolónia alatt felhalmozódott guanót egy-egy fertőzött állat megfertőzi és így nagyobb eséllyel gyűjthető adenovírusos ürülék. A menhelyekre bekerült sérült vagy elpusztult állatok pedig nagyobb eséllyel lehetnek fertőzöttek, mivel bekerülésük egyik oka lehet az adenovírus fertőzés következtében való legyengülés, vagy éppen valamely betegségük miatt szaporodtak el bennük az adenovírusok. A munkánk során kimutatott új vírusok mindegyike jól illeszkedik a már korábban találtak közé; a Vespertilionidae család tagjaiban azonosított vírusokkal alkotnak monofiletikus egységet. Közel rokon hozzájuk a két kutya-adenovírus és az 1-es típusú ló-adenovírus, mely valószínűsíti ezek denevérvírus eredetét. A gazdaváltások és a vírus evolúció tisztázására ígéretes a további célzott mintagyűjtés és víruskeresés, hosszabb virális genomszakaszok megismerése, a lehető legtöbb denevér-taxonból.

In the past couple of decades, great interest is in the research of bat pathogens. Many important viruses threatening also humans were found in this diverse group of mammals such as rabies, SARS, Ebola, Hendra and Nipah viruses. Other bat-borne viruses, like adeno- and herpesviruses, the subjects of our research, are important, too, among other reasons, because of the study of the diversity of viruses. Due to their slower evolution, these DNA viruses are excellent subjects for studying long-term evolutionary processes. In our work, PCR screening of bat samples from Cambodia, Hungary and Transylvania for adeno- and herpesviruses was performed. We found three new adenoviruses in Hungarian samples, all of them originated from different bat species (Lesser mouse-eared bat, Serotine and Soprano pipistrelle). Samples were collected from mist-netted and harp-trapped specimens, so we could certainly identify the host species. The prevalence found by this sampling method was considerably lower than that experienced by guano collection from under colonies and from weak or dead bats. The higher positivity rate in the case of colony guano samples could be explained by the fact that a single infected animal may contaminate a large amount of guano under a colony. The samples from ill or dead bats may contain higher amount of adenoviruses as a consequence of an acute, primary adenovirus infection or virus reactivation due to prolonged disease and weakened immune status caused by any other infection. The newly identified viruses share the overall phylogeny with the earlier described bat adenoviruses; they are monophyletic with the adenoviruses found in other Verpertilionid bats. Their close relatives include the two canine adenoviruses and the equine adenovirus 1, further supporting the presumed common origin. Further targeted host sampling and virus screening, as well as the acquisition of longer viral genome parts from representatives of the utmost bat taxa are promising approaches to continue the study of virus evolution and clarify additional host switches.