Mitokondriális polimorfizmusok kiterjesztett vizsgálata a mangalica sertésfajtában

Abstract

Munkám során a magyarországi mangalica sertés populáció mitokondriális örökítőanyagát vizsgáltam. A fajta vörös, szőke és fecskehasú típusából, meghatározó tenyészetekből random módon vett minták alapján vizsgáltam a genetikai diverzitási értékeket, a DNS alapú fajta vagy típusfelismerés lehetőségét a hazai modern sertésfajtákból származó minták tekintetében, valamint az esetleges a fajta eredetével kapcsolatos információkat. A GenBankból származó szekvenciákkal együtt 68 vizsgálatba vont mintából – melyből 26 mangalica minta volt – meghatároztam a mitokondriális örökítőanyag hipervariábilis régiójának kiterjesztett (638 bázispár hosszú) szakaszának szekvenciáját. A kapott eredmények statisztikai elemzésével megállapítottam a mintán mérhető diverzitási értékeket, melyeket a 6. táblázattal kívántam szemléltetni. A más fajtába tartozó hazai populációkból vett mintákkal és a GenBank-ból letöltött minták segítségével végzett összehasonlítás alapján meghatároztam a mangalica fajta és a külön-külön típusok más fajtától, illetve a vadsertés mintáktól mérhető genetikai távolságát. A legalacsonyabb értéket (Fst: 0,00505) a vadsertés – Iberico minták között, a legmagasabb értéket (Fst: 0,99916) pedig a Meishan – Iberico minták között találtam. Következtetésként megállapítható, hogy: A mangalica fajta vizsgált mintáinak mitokondriális sokszínűsége alacsony, ezért indokolt lenne génmegőrzési célokból az anyai vonalak felkutatása és a mitokondriális vizsgálatok kiterjesztése esetleges további haplotípusok azonosítása érdekében. Továbbá az is megállapítható, hogy az európai vadsertés és a mangalica eredetű minták mitokondriális alapon történő vizsgálattal egymástól nem megkülönböztethetőek.

The aim of this study was the investigation of hyper variable region of mitochondrial DNA in Mangalica swine breed. The diversity indices of all the three type (red, blond, swallow bellied) was determined. The possible mtDNA based breed and widboar recognition was also tested. Based on this information also the phylogenetic context of this typical Hungarian breed was also calculated. An extended (638 bp) region of mtDNA of 26 Mangalica and 30 other international breed samples from Hungarian stocks were sequenced. The diversity indices showed the low diversity in Mangalica breed and types on mitochondrial level. The comparison of Mangalica and the commercial breeds (Hungarian stocks and GenBank downloaded) was showed the low chance of succesfull breed recognition based on the sequenced mtDNA sequences. Not any unique polymorphism were detected which exclusive for Mangalica breed. The genetic distances were calculated between the involved samples, and the highest value was (Fst: 0,99916) between Meishan – Iberico breeds, the lowest value was (Fst: 0,00505) between wild boar – Iberian breeds. The identification of European wildboar samples was also unsuccessful, presumably the separation of this two pool was not strict in the past.