Élőcsíraszám-meghatározás mély neurális hálózatokkal

Abstract

Mikroorganizmusok mennyiségi kimutatása tömeg- vagy térfogat egységre vonatkoztatva általános feladat a mikrobiológia területén, például élelmiszerhigiéniában, infektológiában, vagy biológiai kutatásokban. A szilárd táptalajon végzett vizsgálat esetén telepszámlálással határozzuk meg a minta élőcsíraszámát. Ez a mai napig manuálisan történik, azonban meglehetősen idő- és munkaigényes folyamat, amely jelentős költségeket is von maga után. Az élőcsíraszám-meghatározás automatizálása emiatt már régóta igény. Kutatásunkban - a fejlődő technológia által nyújtott lehetőségeket kihasználva - olyan konvolúciós neurális hálózatot (CNN) alkalmazó algoritmust fejlesztettük, amely képes lehet egy okostelefon által készített képről meghatározni az adott baktérium élőcsíraszámát. Munkánk során 28 mikroorganizmus-fajt tenyésztettünk.