Rövid rekord

dc.contributor.authorFarkas, Szilvia
dc.date.issued2005
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10832/175
dc.description.abstractDoktori tanulmányaim kezdetekor célkitűzésem egy kígyó-eredetű adenovírus izolátum DNS-ének szekvencia-szintű meghatározása és részletes elemzése volt. A témaválasztást alapvetően meghatározták a Ph.D. kutatásaim feltételeit biztosító kutatócsoport korábbi kutatásainak eredményei és az azokra épülő vírusrendszertani javaslataik. A kígyó-adenovírus tanulmányozásával arra a kérdésre szándékoztunk választ találni, hogy mi lehet az Adenoviridae családon belül kialakítani javasolt, új Atadenovirus nemzetség eredete. Az Adenoviridae család több évtizeden át mindössze két (Mastadenovirus és Aviadenovirus) nemzetségből állt, az emlősökből, illetve madarakból izolált vírusok besorolására. A filogenetikai elemzések elterjedése nyomán kiderült, hogy bizonyos szarvasmarha-adenovírusok, melyek a Mastadenovirus nemzetségen belül kivételnek számítottak, valójában egy harmadik, az avi- és mastadenovírusokétól jól elkülönülő leszármazási vonalat képviselnek, érdekes módon egy ugyancsak kivételnek tartott madár-adenovírussal, az úgy nevezett III. csoportba sorolt EDSvírussal (egg drop syndrome virus, 1-es szerotípusú kacsa-adenovírus) együtt. Egy békából izolált adenovírus filogenetikai és genom vizsgálata kimutatta, hogy létezik egy negyedik leszármazási ág is, amit a béka-adenovírus és a másik kivételnek tekintett, korábban az ún. II. csoportba sorolt aviadenovírus, a pulykák vérzéses bélgyulladását okozó THEV (3-as szerotípusú pulyka-adenovírus) alkot. Ezt a csoportot javasolták Siadenovirus néven új nemzetségként elkülöníteni. Feltételeztük, hogy az Atadenovirus nemzetség ismert tagjai esetleg más ősibb gerinces osztály, nevezetesen a hüllők adenovírusaival mutatnak hasonlóságot. A német kollégák által rendelkezésünkre bocsátott, gabonasiklóból (Elaphe guttata) származó adenovírus törzs teljes genomját molekulárisan klónoztuk, DNS szekvenciáját meghatároztuk, és elemeztük. Megállapítottuk, hogy a vizsgált vírus mind genomszerveződése, mind pedig a filogenetikai számítások alapján egyértelműen az időközben hivatalosan is elfogadott Atadenovirus nemzetség tagjai közé sorolható. Részleges szekvenciák alapján megállapítottuk, hogy az általunk vizsgált törzzsel azonosnak tekinthető adenovírusok Németországban, más kígyófajokban is előfordulnak. Királypitonból (Python regius) izolált adenovírus törzs véletlenszerű klónozása során találtunk egy klónt, ami szekvenciája alapján parvovírus eredetűnek bizonyult. Filogenetikai elemzéssel kimutattuk, hogy érdekes, új parvovírus típusból származik. Kanadai tanulmányút keretében elvégeztem a kígyó-parvovírus (serpentine adenoasszociált vírus, SAAV) teljes genomjának szekvenálását, és egy darabban történő molekuláris klónozását. A SAAV genomjának elemzése és törzsfa rekonstrukciós számítások alapján kimutattuk, hogy az a Dependovirus nemzetségbe sorolható. Munkám elméleti jelentősége, hogy a világon legelsőként elemeztünk hüllő-adenovírus és -parvovírus genomot. Gyakorlati szempontból fontos eredményeim között e vírusok génkifejező vektorként történő esetleges hasznosítása, valamint modern diagnosztikai módszerek megalapozása említhető.hu
dc.language.isohuhu
dc.subjectAdenovírusokhu
dc.subjectParvovírusokhu
dc.subjectGénkészlethu
dc.subjectHüllőkhu
dc.subjectLaboratóriumi módszerhu
dc.subjectMorfológiahu
dc.subjectKlónozáshu
dc.subjectMolekuláris genetikahu
dc.subjectKígyókhu
dc.subjectAdenoviridaeen
dc.subjectParvoviridaeen
dc.subjectGenomeen
dc.subjectReptiliaen
dc.subjectLaboratory methodsen
dc.subjectMorphologyen
dc.subjectCloningen
dc.subjectMolecular geneticen
dc.subjectSnakesen
dc.titleKígyó-adeno- és parvovírus teljes genomjának szekvenciája és analízise, minkét víruscsaládban az első molekuláris elemzések hüllő-eredetű izolátummalhu
dc.typePhD dissertationen
dc.identifier.accessionnum82489


A tételhez tartozó fájlok

Thumbnail
Thumbnail

Ez a dokumentum a következő gyűjtemény(ek)hez tartozik:

Rövid rekord