Arapapagáj mikroszatellita-markerek rokon fajok közötti tesztelése

Abstract

ÖSSZEFOGLALÁS A papagájfajok szabadon élő, ill. fogságban tartott populációinak monitorozásához szükség van megfelelő felbontást adó genetikai markerek alkalmazására, amelyek de novo kifejlesztése azonban költséges. Ehelyett érdemes a már meglévő, közel rokon fajokra kifejlesztett "cross-species" markereket használni. A szerzők célja egy olyan mikroszatellita-markerkészlet kialakítása volt, amely eredményesen alkalmazható az Araformák (Arinae) alcsaládba tartozó fajokban. Ehhez tíz, kéksárga ara (Ara ararauna) és sárgaszárnyú ara (Ara macao) fajokra tervezett lokuszt teszteltek 12 papagájfaj 149 egyedén, amelyek többnyire polimorfnak bizonyultak, így a legtöbb megvizsgált fajban alkalmasak genotipizálásra. A tesztelt markereket alkalmazva megállapítható, hogy az A. ararauna, A. macao és A. chloropterus fajok magyarországi tenyészállományai nem beltenyésztettek.

SUMMARY Background: In the last few decades, microsatellites have become the most widely used genetic markers in genotyping. As an alternative to their expensive de novo marker development, cross-species utilisation of microsatellite primer sets features a highly cost-effective solution. The success of this method depends on several factors, one of which is probably the evolutionary distance between the source species and the target species. Objectives: The authors present a cross-species amplification study in Arinae parrots. First, they tested whether microsatellite markers originally developed for Ara ararauna and Ara macao are applicable to a wider range of parrot taxa. Moreover, using the tested markers, they assessed the extent of inbreeding in Hungarian captive-bred populations of three Ara species. Materials and Methods: Published PCR protocols were available for all markers in the original species. After performing conventional PCR reactions, products were visualized on agarose gel. This step was followed by capillary electrophoresis to determine exact amplicon sizes and thus, to identify alleles in each species. Results and Discussion: The majority of the loci were successfully amplified in most of the species, showing high variability even in the most distantly related taxa. The ratio of closely related individuals in the tested three Ara species was relatively low, with no sign of inbreeding in any of the bred populations, maybe due to the incidental international import of birds to the local aviculture.